Die Gächinger Kantorei Stuttgart ist einer der profiliertesten Chöre Deutschlands, der vor allem mit seinem Gründer und langjährigen künstlerischen Leiter Helmuth Rilling ein Millionenpublikum für die Chormusik gewonnen hat. Die Gächinger Kantorei ist das Herzstück der Bachakademie und repräsentiert diese und das Land Baden-Württemberg auf Gastspielen im In- und Ausland. Mit dem Bach-Collegium Stuttgart besitzt die Gächinger Kantorei einen hochkarätigen instrumentalen Partner, der auch in eigenen Orchesterkonzerten auftritt.

Das erfolgreiche Modell des Festivalensemble Stuttgart, 2001 von Helmuth Rilling gegründet, wird seit 2011 mit dem JSB Ensemble im Rahmen der Bachwoche Stuttgart weitergeführt und intensiviert. Es versammelt junge Musikerinnen und Musiker aus der ganzen Welt zu einem Ensemble aus Chor und Orchester – eine einzigartige Kombination, die die zentralen Aspekte der Bachakademie betont: die Förderung junger Menschen und die internationale Ausstrahlung der akademischen Arbeit. Der Junge Chor der Bachakademie findet sich seit 2004 regelmäßig zusammen, um in den großen musikalischen Gottesdiensten der Bachwoche und des Musikfestes Stuttgart mitzuwirken.